東南亞地區大量的森林消失造成了氣候變遷，也破壞當地的生物多樣性。基於需求面，幾乎所有亞洲國家，都沒有法令禁止非法砍伐的原本進口。國家政府試著透過執照、限量、保留林等來管理本國的森林資源，例如：中國禁止國內伐林。結果，緬甸成了提供中國木材來源的國家。泰國也是為了滿足需求，從緬甸、寮國和柬埔寨進口林材。據估計，光二○○○年到二○○五年間，柬埔寨就少了三十巴仙的原始林。寮國、馬來西亞都禁止木材出口，但總是會有非法走私的木材。現在這樣的風氣，也將從泰國、菲律賓漫延到印尼這個東南亞之肺。
東協若不敢面對森林砍伐問題時，則會把霾害拿出來討論，因為霾害是由於森林大火所造成的空氣污梁。在東南亞主要的霾害製造來源就是印尼的佳里曼丹(Kalimantan)省和蘇門答臘(Sumatra)，而且這影響擴及新加坡、馬來西亞、泰國、菲律賓、澳洲長達七個月之久，公共衛生遭受嚴重的危害。通常森林大火的起因可分為人為和自然的。自然地自燃有之，但往往是由於人類造成的付出較高成本。一但一個地方起了森林大火，所有事務都被延宕。加上印尼中央權力較弱、去中心化和腐敗，一但大火發生，便一發不可收拾。在二○○二年，東協簽署了跨國境的霾害污染協定，此協定提出各國共同監控、評估、預防、科學技術合作、協調機制、熱線等，並在霾害發生，以最簡便通關方式，讓受難者快速免於災禍。但二○○六年，印尼的霾害又發生了，除了印尼總理道歉外，新加坡、馬來西亞、泰國、菲律賓、澳洲五個受影響最大的國家還提出了「霾害基金」以解決霾害。
新加坡想將霾害議題，提交到聯合國，但這使得印尼總理相當不爽。許多印尼民族自決主張者認為東協只提出印尼的霾害，其它在印尼的廢棄物、新加坡的沙石廠、馬來西亞的非法伐木、泰國偷補印尼領海的魚…等，都未被提及。因此這個跨國境的霾害污染協定並未在印尼國會被批准。本文作者認為這個別國家行為，不是東協模式。
再來我們討論水資源的議題。除了寮國之外，其它東南亞區域國家都是和海相接的國家。魚，也自然而然成了東南亞主要蛋白質的來源了，然而若無限制的過度捕撈而破壞了大自然能夠自然再生產的循環，這樣的影響將永久不能恢復。關於海洋資源，主要聚焦在三個議題：棲地破壞、過度捕撈和來自陸地的污染。而內陸的水資源，最主要就是築水壩的議題，通常這會關連環境、社會、經濟等問題。首先，築了水壩後，原先自然的汎期泛濫就因為水壩破壞了，更甭提生物多樣性、遷村、魚獲減少、下游水量及營養物質的變化等。蓋水壩受衝擊的總是政治意識較弱的地方。泰國的巴幕(Pak Mun)水壩和印尼的巴坤(Bakun)水壩都被評估不適宜建設，但卻都蓋起來了。湄公河流域流經的各國也都試圖利用湄公河的水力逕行利用，但下游的國家總是抱怨上游國家把水用光了，柬埔寨和越南就是受害者。中國在上游，二○一二年將完成全中國第二大的水壩，這使得下游的寮國和泰國備受危脅。和三峽大壩一樣，許多國家在建設水壩時，都不得不犧牲國家公園或森林保留區被淹沒的悲劇。
目前看來，東協仍未有能力能夠介入各國保護環境的政策；而各國也基於經濟利益，而必須從消耗環境中獲利。