為什麼要用文獻管理軟體？研究生2.0曾經撰文告訴大家十個理由。研究生2.0使用文獻管理軟體的理由，我都同意。但我認為大多數研究生不會因為文獻管理軟體有諸多好處，而去使用它。對研究生而言，管理文獻只是為了人生中一篇僅僅為了畢業撰寫的論文，畢業後剩餘的人生根本不需要再寫論文，我根本不需要使用文獻管理軟體。
我思考自己使用文獻管理軟體的原因是因為修了《數位媒體編輯》。《數位媒體編輯》這門課不是讓我學會文獻管理軟體的課，它讓我學到的「工具獨立性」和「心智外包」(Extended Mind)。工具獨立性，是指可以用任何的軟體，達成一件整合性的作品。心智外包就是把原本應該親自花費心力的事，交給工具去完成。
《數位媒體編輯》的每一週課就是教你使用Word。但是學期作業要你作出一個雜誌，你可以使用Word，也可以使用InDesign，也可以使用各式各樣你覺得能夠完成雜誌所需的軟體。用Word，誰不會！反正就把Word打開，打字就好了，換個字型、換個顏色、放個圖片、用什麼文字藝術師就可以漂漂亮亮了，這個國小電腦課東西居然在大學一個三學分的《數位媒體編輯》進行！如果這樣的話，微軟公司也太好混了吧！Word有很多選單裡頭能做到的事，我們都沒注意過。這堂課當然不是在學Word的使用技術，我們學的是編輯一個雜誌，需要哪些技術，而這些技術在Word上怎麼辦到。知道哪些部分是軟體可以代替人力辦到的，我們就從工人智慧往人工智慧又進了一步。
因為工具獨立性和心智外包，電腦能做的事，自己就不去做；開源軟體能做的事，就不去使用付費的軟體。作業系統有很多，windows、ios，但是我使用ubuntu；統計軟體有很多，SAS、spss，但是我使用R；有名的辦公室軟體Microsoft Officea我也沒用，我用Libreoffice；文獻管理軟體也很多EndNote、Mendely、zotero，一開始猶豫使用zotero或JabRef，付年費使用2年的zotero之後，後來還是使用JabRef。
zotero因為能夠和Firefox瀏覽器上加上套件進行文獻管理，而且可以在Libreoffice的文件編輯的同時，進行文獻引用，因此網路上的資訊相對豐富，進入門檻就比較低。(當然，我想可能還是因為zotero進行收費，所以能夠有組織去使它變得更親民)
JabRef早期大多只有使用LaTeX撰寫科技論文的研究者使用，網路上的資訊也不多，門檻高，我都還沒進去就先放棄了。
但是，我使用zotero年費，每年是30塊美元，能夠管理的文獻數量只有2GB，在文獻一直增加的情況下，下一個級距就是6GB，我就必須付出年費60塊美元。因此，我還是再研究JabRef。五、六年的發展，JabRef有許多更親民的改變。但是，對於初初使用文獻管理軟體的人，恐怕還是不太容易。
我把一些可能遇到的問題和解決的方案收錄在下面，這些做法都是在lubuntu的作業系統下，使用LibreOffice可以參考的內容：
我怎麼樣可以LibreOffice上，用JabRef引用文獻？
我怎麼樣可以在使用文書軟體時，讓引用的文獻是符合APA的格式？
在JabRef上可以透過選擇.jstyle的檔案，使文獻引用符合自己所需要的格式。我沒有那麼努力自己去編輯，因為有網友提供了適合的.jstyle。今年二月有網友分享了許多期刊的格式，但是仍然缺少APA的格式。APA是很多期刊文獻引用的格式，今年5月有人提供了APA的.jstyle。
那些.jstyle適用於word，我用的是LibreOffice，怎麼辦？
適用於LibreOffice的.jstyle，有網友提供範例，只要依照範例和自己所需要的.jstyle去將兩個文件合併在一塊就可以。